凝聚态物理研究所是理学院于2019年新成立的研究所，为理学院下属院级单位。现有成员7人，其中教授3人，副教授3人，讲师1人；有浙江省特聘教授1人。主要研究方向包括：量子梳计与量子纠缠、低维经典系统热传导、非晶合金与能源材料的结构和物性、液体金属动力学模拟、生物分子结构与环境等。研究所成员近年来于Nature子刊、Annual Review系列、Advanced Materials、Physical Review系列、Journal of Chemical Theory and Computation等国际著名刊物发表论文多篇。